中央红军主力长征后，国民党数十万军队和地方反动武装，采取“碉堡围困”“经济封锁”“保甲连坐”等手段，企图将留守苏区的红军全部围歼。
为有效地牵制敌军，掩护主力红军的战略转移行动，中央分局、中央政府办事处、中央军区率领3万多留守红军与数十倍于己之敌展开殊死搏战。短短两个多月，在激烈战斗中红军仅剩下5000余人，中央分局除了能与赣南省直接联系外，同其他根据地大都失了联系。
面对严峻形势，项英发电请示中央，陈毅提议突围。遵义会议后，中央分局按照党中央的电报指示，改变斗争策略和方法，变大部队的集团行动为小部队的分散活动，将部队化整为零，分九路突围开展游击战争。
1935年3月上旬，项英在向党中央电告部队突围情况后，埋掉电台，与陈毅等率领的坚守在于都南部地区的部队和机关工作人员分路向南突围。经过浴血奋战，冲破了敌人设下的重重封锁线，到达赣粤边境的油山地区，与李乐天、杨尚奎领导的赣粤边特委和当地红军游击队会合。在突围战斗中，中央军区政治部主任贺昌、赣南省委书记兼赣南军区政委阮啸仙英勇牺牲，赣南军区政治部主任刘伯坚受伤被俘，不久被敌人杀害。何叔衡、瞿秋白等重要领导人先后牺牲。
各路红军部队突围以后，在与上级失去联系的情况下，紧紧依靠党的领导和广大人民群众的支援，采取灵活机动的游击战术，克服常人难以忍受的困难，在深山密林中坚持了艰苦的三年游击战争。
当时江西边界有6块游击区：赣粤边游击区、湘赣边游击区、闽赣边游击区、汀瑞游击区、湘鄂赣边游击区和皖浙赣边游击区。这6块游击区的斗争，是南方八省游击斗争的重要组成部分，它牵制和消耗了敌人的有生力量，在战略上有力地支援了主力红军长征。它保存了一批革命的骨干力量，成为党在南方的重要战略支点。
抗日战争爆发前后，国共两党在江西进行了合作谈判。1937年12月，新四军军部在武汉组建。1938年1月，新四军军部在南昌正式办公。江西各红军游击队与南方其他各游击区的红军游击队纷纷下山，集中整训改编为新四军，开赴华中抗日前线，成为抗击日军的劲旅。